Колокольня Николо-Дворищенского собора, построенная, предположительно, артелью московских каменщиков, возводивших в 1686 году паперть Никольского собра - одна из самых ранних датированных новгородских построек такого типа, получившего распространение в Новгороде в последней трети XVII в. Из рукописного хронографа XVIII в. следует, что постройка сооружена за два летне-осенних сезона 1684-1685 гг.: «Да в том же годе (7192/1684 г.) каменную колокольню завели строить и построили до половины в том годе, а достроили …во 193 году до самого креста в последних числех августа. А крест поставили в 194 году сентября в (?), а главу допаяли того же месяца в 15 день». 

Судя по изображению на иконе «Богоматерь Знамение»  рубежа XVII-XVIII вв. колокольня вместе с ц. Жен Мироносиц, Воротной башней и соединяющими их каменными лавками входила в восточную линию застройки Гостиного двора, заложенного в 1692 г. по указу Петра I, и представлявшего замкнутый комплекс построек,  расположенных вокруг двора в форме каре.

Памятник представляет собой  характерный образец шатровых колоколен типа «восьмерик на четверике»: нижний ярус  прямоугольный, верхние – восьмигранные, с уменьшенными промежуточными гранями. Восточный и южный фасады четверика (северный и западный закрыты примыкающими к ним постройками)  расчленены лопатками в центре и на углах, причем средние лопатки «висячие»,  не опускаются до цоколя, а упираются в дверные проемы. Восьмерик (кроме яруса звона) имеет лопатки только на углах граней. Фасады расчленены на  ярусы декоративными фризами из квадратных двухуступчатых ниш и горизонтальных профилированных тяг.  На восточном фасаде в нижнем и среднем ярусах восьмерика расположены два прямоугольных окна, вписанных в небольшие полуциркульные ниши. Верхнее окно –  обрамлено наличником-рамкой с двумя кокошниками.

Ярус звона с восемью арками,  заглубленными в ниши с трехуступчатым килевидным завершением, огражден кирпичным парапетом. Сооружение завершает восьмигранный шатер с двумя рядами узких слухов  и  гуртами, увенчанный небольшой главкой с крестом на невысокой граненой шейке. Устройство в гранях шатра двух рядов узких слуховых окон было шагом вперед при строительстве колокольни, т.к. улучшало акустические возможности этого сооружения.

Внутреннее  пространство разделено на пять ярусов. В южной стене устроена каменная лестница, ведущая  на второй ярус, остальные ярусы сообщаются открытыми деревянными лестницами с перилами. 

Первый колокол для Никольской колокольни, весом 106 пудов, доставили из Москвы. На нем значилась редкая надпись с изложением фрагмента из Четвертой  книги Моисея о серебряных трубах – символическом прообразе колоколов: «Лета 1687 декабря 6 из Св. Писания, о сотворении Моисеем труб кованых и серебряных и употреблении их во время новомесячий» (песнопений)». Во время пожара 1745 г. в Никольском соборе на колокольне сгорело 5 колоколов и 2 разбилось.  В 1748 г. на колокольню вновь повесили 5 колоколов – большой в 110 пудов, средний в 15, «третий битой» - в 15, два зазвонных – по 8 пудов. В 1860 г. на ярусе звона висело 6 колоколов, а 1913 г.  уже 8.

В 2002 г. с колокольни Николо-Дворищенского собора для экспонирования на Софийской звоннице были сняты два колокола: 1687 г. мастера Михайло Лодыгина и колокол 1751 г. с надписью, повествующей о том, что «ВЫМЕНЕн СЕи КОЛОКОл в НОВГОРОд БОГОсЛОВСКОи ДВИЧЪ МАНАсТЫр».

В годы фашистской оккупации в значительной степени было повреждено покрытие шатра, стены имели многочисленные пробоины от снарядов, перекрытия полностью разобраны.

В 1951-1952 гг. проведен капитальный ремонт с восстановлением всех элементов, утраченных в годы Великой Отечественной войны: вычинены и оштукатурены стены, заменено покрытие шатра, устроены новые перекрытия и лестницы. В дальнейшем с большей или меньшей регулярностью проводились ремонтные работы.

В 2021 году будут закончены проектные работы на реставрацию памятника, которые, предположительно будут выполнены в 2022-2024 гг.